[ad_1]
Les salles de bains d’avion ne sont pas l’idée que la plupart des gens passent un bon moment. Ils sont à peine assez grands pour faire demi-tour. Leurs portes collent, comme s’ils essayaient de vous piéger sur place. C’est sans parler de l’odeur. Mais pour le CDC, ces mêmes salles de bains pourraient être une mine d’or de données.
Ce mois-ci, l’agence s’est entretenue avec Concentric, la branche de santé publique et de biosécurité de la société de biotechnologie Ginkgo Bioworks, au sujet du dépistage des eaux usées des avions pour le COVID-19 dans les aéroports du pays. Bien que des tests sur les eaux usées des avions aient déjà été en cours (un programme pilote à l’aéroport international John F. Kennedy, à New York, s’est terminé l’été dernier), des inquiétudes concernant une nouvelle variante survenant en Chine après la fin de son « zéro COVID » Les politiques ont agi comme un «catalyseur» pour le projet, m’a dit Matt McKnight, directeur général de Ginkgo pour la biosécurité. Selon Ginkgo, même les administrateurs d’aéroport s’énervent. « Il y a eu quelques aéroports qui ont en fait contacté le CDC pour demander à faire partie du programme », m’a dit Laura Bronner, vice-présidente des stratégies commerciales de Ginkgo.
Les tests des eaux usées des avions sont sur le point de révolutionner la façon dont nous suivons les mutations continues du coronavirus dans le monde, ainsi que d’autres virus courants tels que la grippe et le VRS, et les menaces pour la santé publique que les scientifiques ne connaissent même pas encore. Contrairement à la surveillance à l’échelle des égouts, qui nous montre comment les maladies se propagent dans de grandes communautés, la surveillance par avion est précisément ciblée pour détecter de nouvelles variantes entrant dans le pays depuis l’étranger. Et contrairement aux tests PCR, les passagers n’ont pas à s’inscrire individuellement. (Les résultats restent anonymes dans tous les cas.) McKnight compare la technique au radar : au lieu de répondre à une attaque après son déploiement, l’Amérique peut être avertie à l’avance des nouvelles menaces. avant qu’ils ne causent des problèmes. Alors que nous entrons dans une ère où la plupart des gens ne centrent pas leur vie sur l’évitement du COVID-19, notre meilleure contribution à la santé publique pourrait être d’utiliser des toilettes à 30 000 pieds.
Fondamentalement, les tests d’eaux usées sur les avions sont une version à plus petite échelle de la surveillance qui a lieu sur les réseaux d’eau municipaux depuis le début de 2020 : les chercheurs effectuent des tests génétiques sur des échantillons d’eaux usées pour déterminer la quantité de coronavirus présente et les variantes incluses. Mais adapter la méthodologie aux avions demandera aux chercheurs de faire preuve de créativité. D’une part, les eaux usées des avions ont un rapport solide/liquide plus élevé. Les eaux usées municipales proviennent du bain, de la cuisine, du lavage des vêtements et d’autres activités, tandis que les eaux usées des avions «proviennent principalement des toilettes», explique Kata Farkas, microbiologiste à l’Université de Bangor. Pour une étude récente sur le suivi du COVID-19 dans les aéroports britanniques, Farkas et ses collègues ont dû ajuster leurs méthodes d’analyse, peaufiner les produits chimiques et les techniques de laboratoire utilisés pour isoler le coronavirus des eaux usées des avions.
Les chercheurs doivent également sélectionner les vols avec soin pour s’assurer que les données qu’ils recueillent valent l’effort de les collecter. Pour le dire franchement, tout le monde ne fait pas caca dans l’avion – et si le nombre total de passagers échantillonnés est très petit, l’analyse ne fournira probablement pas beaucoup de données utiles. « Le nombre de conversations que nous avons eues sur la façon de savoir discrètement combien de personnes sur un vol sont entrées dans les toilettes est hystérique », déclare Casandra Philipson, qui dirige le programme de bioinformatique concentrique. (Concentric a précisé plus tard qu’ils n’avaient pas l’intention de surveiller réellement l’utilisation des toilettes par les passagers.) Les chercheurs ont finalement opté pour une métrique plus simple : les vols plus longs ont tendance à utiliser davantage les toilettes et devraient donc faire l’objet de tests sur les eaux usées. (Philipson et ses collègues travaillent également avec le CDC pour tester des vols en provenance de pays où le gouvernement est particulièrement intéressé à identifier de nouvelles variantes.)
Au-delà de ces défis techniques, les scientifiques sont confrontés à la tâche ardue de collaborer avec les aéroports et les compagnies aériennes, de grandes entreprises qui n’ont pas l’habitude de participer à la surveillance de la santé publique. «C’est un environnement difficile à travailler», explique Jordan Schmidt, directeur des applications de produits chez LuminUltra, une société canadienne de biotechnologie qui teste les eaux usées à l’aéroport Pearson de Toronto. Une sécurité stricte et des bureaucraties complexes dans les voyages aériens peuvent rendre difficile la collecte d’échantillons à partir d’avions individuels, m’a-t-il dit. Au lieu de cela, LuminUltra prélève des échantillons dans les terminaux d’aéroport et dans les camions qui extraient les eaux usées de plusieurs avions, de sorte que l’entreprise n’a pas besoin d’obtenir l’adhésion des compagnies aériennes.
La surveillance des avions cherche à suivre de nouvelles variantes, et non des passagers individuels : les chercheurs ne recherchent pas exactement quelle personne a introduit une souche virale particulière dans le pays. Pour cette raison, des entreprises telles que Concentric ne prévoient pas d’alerter les passagers que le COVID-19 a été trouvé sur leur vol, tout comme certains d’entre nous pourraient apprécier cet avertissement. Tester les eaux usées des avions peut identifier des variantes du monde entier, mais cela ne nous informera pas nécessairement des nouvelles surtensions dans la ville où ces avions atterrissent.
L’analyse des eaux usées des avions offre plusieurs avantages aux épidémiologistes. En général, tester les eaux usées est « considérablement moins cher » et « considérablement moins invasif » que le test par écouvillonnage nasal de chaque personne dans une ville ou dans un avion, déclare Rob Knight, professeur de génie médical à l’UC San Diego qui dirige les eaux usées de l’université. programme de veille. Plus tôt ce mois-ci, un rapport historique des Académies nationales des sciences, de l’ingénierie et de la médecine (dont Knight est co-auteur) a souligné que les aéroports internationaux étaient des endroits idéaux pour rechercher de nouvelles variantes de coronavirus et d’autres agents pathogènes. « Vous allez capturer des gens qui voyagent d’autres parties du monde où ils pourraient apporter de nouvelles variantes », m’a dit Knight. Et attraper ces nouvelles variantes tôt est essentiel pour mettre à jour nos vaccins et traitements afin de garantir qu’ils continuent de bien fonctionner contre le COVID-19. La collecte de plus de données auprès de personnes voyageant à l’intérieur du pays pourrait également être utile, a déclaré Knight, car les variantes peuvent évoluer aussi facilement chez eux qu’à l’étranger. (XBB.1.5, la dernière variante dominant la propagation du COVID-19 aux États-Unis, serait originaire du nord-est américain.) À cette fin, m’a-t-il dit, le CDC devrait également envisager de surveiller les grandes gares ou les ports maritimes.
Lorsque les tests des eaux usées ont commencé pendant la pandémie, l’accent était principalement mis sur les installations municipales, car elles pouvaient fournir des données pour une ville ou un comté entier à la fois. Mais les scientifiques ont depuis réalisé qu’une vision plus précise de nos déchets peut être utile, en particulier dans des contextes cruciaux pour éclairer les actions de santé publique. Par exemple, à NYC Health + Hospitals, le système de santé public de la ville, les données sur les eaux usées aident les administrateurs à « voir 10 à 14 jours à l’avance s’il y a des augmentations » du coronavirus, de la grippe ou du mpox, Leopolda Silvera, Health + Hospitals’ adjoint à la santé mondiale, m’a dit. Les administrateurs utilisent les données dans les décisions concernant les mesures de sécurité et où envoyer les ressources, a déclaré Silvera : Si les eaux usées d’un hôpital indiquent un pic à venir dans les cas de COVID-19, du personnel supplémentaire peut être ajouté à son service d’urgence.
Les écoles sont une autre cible évidente pour les tests d’eaux usées à petite échelle. À San Diego, Rebecca Fielding-Miller a dirigé un programme de surveillance de deux ans pour les écoles élémentaires. Il s’est spécifiquement concentré sur les communautés mal desservies, y compris les réfugiés et les travailleurs à faible revenu qui hésitaient à rechercher des tests PCR. Des tests réguliers des eaux usées ont détecté des cas asymptomatiques avec une grande précision, fournissant au personnel de l’école et aux parents des informations « à la minute près » sur la propagation du COVID-19 dans leurs bâtiments, m’a dit Fielding-Miller. Cette année scolaire, cependant, le financement du programme s’est épuisé.
Même la surveillance au niveau du quartier, bien qu’elle ne soit pas aussi granulaire que l’échantillonnage dans un avion, un hôpital ou une école, peut fournir des données plus utiles que les tests à l’échelle de la ville. À Boston, « nous voulions vraiment une surveillance hyperlocale » pour informer les emplacements des cliniques de vaccination, des sites de test et d’autres services de santé publique de la ville, explique Kathryn Hall, sous-commissaire à l’agence de santé publique de la ville. Elle et ses collègues ont identifié 11 plaques d’égout qui offrent une « bonne couverture » de quartiers spécifiques et pourraient être testées sans trop perturber la circulation. Lorsqu’un site de test s’illumine avec des chiffres élevés de COVID-19, les collègues de Hall contactent des organisations communautaires telles que des centres de santé et des résidences pour personnes âgées. « Nous nous assurons qu’ils ont accès à des rappels, qu’ils ont accès à des EPI, qu’ils comprennent ce qui se passe », m’a dit Hall. Dans la ville voisine de Revere, un programme similaire géré par la société CIC Health a montré une augmentation du VRS dans les eaux usées du quartier avant que le virus ne fasse la une des journaux. CIC a partagé la nouvelle avec les garderies et les a aidées à répondre à la vague avec des informations éducatives et des EPI.
Selon les experts des eaux usées, les programmes hyperlocaux ne peuvent pas à eux seuls inaugurer un avenir de maladie omnipotente. Colleen Naughton, professeure d’ingénierie environnementale à UC Merced qui gère le tableau de bord COVIDPoops19, m’a dit qu’elle aimerait voir les communautés sans surveillance des eaux usées obtenir des ressources pour la mettre en place avant que davantage de fonds ne soient consacrés aux tests de bâtiments individuels ou de plaques d’égout. Le récent rapport des National Academies présente un avenir de la surveillance des eaux usées qui comprend à la fois une surveillance étendue à travers le pays et des tests ciblés sur les endroits où de nouvelles menaces pour la santé pourraient émerger ou là où certaines communautés ont besoin d’informations locales pour rester en sécurité.
Cet avenir nécessitera un financement fédéral soutenu au-delà de l’urgence actuelle du COVID-19, qui devrait expirer si l’administration Biden ne le renouvelle pas en avril. Les États-Unis ont besoin « de technologies meilleures et plus nombreuses, avec un modèle de financement qui soutient son développement », afin que le véritable potentiel des eaux usées se réalise, a déclaré Knight. Les toilettes des avions pourraient très bien être le meilleur premier pas vers cet avenir complet de surveillance des eaux usées.
[ad_2]
Source link -30