Omicron Origin Study : l’évolution a tout simplement été ignorée

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Coronavirus en Afrique du Sud

Selon un rapport, le développement d’Omicron a tout simplement été ignoré – il aurait pu être remarqué plus tôt.

(Photo: dpa)

Berlin Le coronavirus d’origine a été suivi par alpha, bêta, gamma et delta en tant que variantes à haute transmissibilité. Tous les quelques mois, une nouvelle variante émergeait, dont certaines devenaient rapidement dominantes. Fin 2021, Omikron est apparu – et est resté. Selon une étude de la Charité Berlin publiée dans la revue Science, il y avait des précurseurs d’omicron sur le continent africain bien avant la première détection en novembre 2021.

Contrairement à ce que supposent les hypothèses répandues sur l’origine, la variante s’est développée progressivement sur plusieurs mois dans différents pays africains. Ce développement a simplement été négligé en raison d’un manque d’analyse.

Le 26 novembre, l’Organisation mondiale de la santé (OMS) a classé la variante corona B.1.1.529, qui a été détectée pour la première fois en Afrique du Sud le 9 novembre 2021, comme « préoccupante ». Malgré des restrictions de voyage massives, l’omicron s’est propagé rapidement dans le monde entier et a provoqué un nombre extrêmement élevé d’infections. Fin décembre 2021, la variante avait déjà remplacé le virus Delta auparavant dominant.

À ce jour, les sous-types d’omicron dominent le processus d’infection dans le monde entier – et ébranlent actuellement la stratégie zéro-Covid de la Chine.

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Comparé au Sars-CoV-2 original de Wuhan, Omicron présentait un nombre inhabituellement élevé d’environ 30 changements d’acides aminés dans la seule protéine de pointe. Le grand nombre de modifications génétiques a conduit les experts à supposer que la variante aurait pu se développer chez une personne atteinte du VIH ou d’une autre forme de déficit immunitaire. Une autre hypothèse suppose que les omicrons se sont développés chez les animaux puis sont revenus aux humains.

L’idée derrière l’hypothèse de l’immunodéficience : chez les personnes dont le système immunitaire est affaibli, le Sars-CoV-2 aurait pu se multiplier pendant plusieurs mois et changer petit à petit sans jamais être désactivé par le système immunitaire. De nombreux patients atteints du VIH en Afrique ne sont pas traités de manière adéquate, c’est pourquoi leur système immunitaire est considérablement affaibli, ont expliqué les experts. « Les nombreuses mutations parlent pour le développement chez les patients atteints du VIH », a déclaré l’expert en santé du SPD à l’époque, Karl Lauterbach.

Charité de Berlin

Selon les scientifiques, omicron possède différents précurseurs qui se mélangent les uns aux autres.

(Photo : imago images/Mike Schmidt)

Pour l’étude « Science », les scientifiques de la Charité dirigés par Jan Felix Drexler, en collaboration avec des partenaires de coopération africains, ont examiné des échantillons corona qui ont été collectés avant la découverte de l’omicron en Afrique du Sud et après. Plus de 13 000 échantillons provenant de 22 pays africains ont été soumis à un test PCR spécial.

L’équipe de recherche a trouvé des virus avec des mutations spécifiques à l’omicron chez 25 personnes de 6 pays qui avaient déjà contracté le Covid-19 en août et septembre 2021, des mois avant la première détection en Afrique du Sud.

De plus, le génome viral a été décodé dans environ 670 échantillons. Plusieurs virus ont été trouvés qui présentaient des similitudes avec omicron, mais n’étaient pas identiques. « Nos données montrent que les omicrons avaient des progéniteurs différents qui se sont mélangés et ont circulé en Afrique en même temps et pendant des mois », explique Drexler. « Cela indique une évolution progressive de la variante BA.1 omicron, au cours de laquelle le virus s’est de mieux en mieux adapté à l’immunité existante de l’homme.

Les scientifiques concluent également à partir des données que les omicrons ont d’abord dominé le processus d’infection en Afrique du Sud, puis se sont propagés du sud au nord à travers le continent africain en quelques semaines.

« L’apparition soudaine de l’omicron n’est donc pas due à un transfert du règne animal ou au développement chez une personne immunodéprimée, même si cela a pu également contribuer au développement du virus », conclut Drexler. « Le fait que nous ayons été surpris par Omikron est plutôt dû à l’angle mort du diagnostic dans de grandes parties de l’Afrique, où probablement seulement une fraction des infections à Sars-CoV-2 sont même enregistrées. »

Suite: Surveillance totale et répression : la transformation dangereuse de la Chine

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